Ученый не согласилась с решением исполняющего обязанности ректора Игоря Мурога закрыть научно-исследовательскую лабораторию по изучению и охране биоразнообразия. Эту лабораторию основали в РГУ еще 1995 году, Казакова была ее бессменным руководителем.
В творческой копилке Марины Казаковой – более 500 работ, в том числе посвященных флоре и фауне Рязанской области. Она принимала участие в работе над Красной книгой региона. Возглавляла Рязанское отделение Русского ботанического общества. По ее инициативе в университете проходили крупные конференции.